• <p id="uyspl"></p>
    <p id="uyspl"><label id="uyspl"><xmp id="uyspl"></xmp></label></p>
      <pre id="uyspl"><ruby id="uyspl"></ruby></pre>
    1. <pre id="uyspl"><del id="uyspl"><xmp id="uyspl"></xmp></del></pre>

      <td id="uyspl"></td>

      1. <table id="uyspl"></table>
        <table id="uyspl"></table>
          <td id="uyspl"><ruby id="uyspl"></ruby></td>
          1. 这是描述信息

            DNA 6mA免疫沉淀测序 (6mA-IP Seq)

            项目介绍
            参数
            常见问题
            应用案例

             

            DNA 6mA免疫沉淀测序(6mA-IP Seq)

             

            N6-甲基脱氧腺苷(6mA)是原核生物和真核生物的DNA修饰类型之一,

            在细菌、藻类及植物基因组中广泛存在,在DNA错配修复、染色体分离和毒力调节中发挥作用。

            6mA免疫沉淀测序(6mA-IP Seq)通过特异性抗体富集6mA甲基化的DNA片段,结合NGS测序技术在全基因组水平上分析6mA修饰信息。

             

            用心服务每一个项目

            专注表观组学10年,提供专业有价值的DNA甲基化完整解决方案;

            国内较早开发6mA-seq技术团队之一, 严格的内参质控;

            已经完成藻类及动植物及人等多个物种6mA-seq项目经验;

            专业的生物信息分析团队, 提供更多个性化分析思路和方案。

             

             

            科学方案设计

            从项目方案、样本处理、建库测序,到数据分析;

            每个项目需要专业、有价值的建议;及时高效的沟通,以保障高质量研究成果。

             

             

            样本类型和要求

            样本类型

            样本要求

            基因组DNA

            总量≥ 5ug; 浓度≥ 50ng/ul; 基于Qubit定量

            动植物、藻类、低等生物等

            按照送样要求准备

            备注:用封口膜密封样品; 干冰运输

             

             

            数据分析

            6mA-IP Seq

            分析内容

            备注

            标准分析

            1、测序数据质量评估

            过滤掉低质量数据,保证数据质量

            2、与参考基因组比对

            测序Reads 在基因组上的分布

            3、6mAPeak峰Calling

            6mADNA富集区域鉴定

            4、6mAPeak图谱分析

            6mAPeak在基因组,染色体,功能元件上的分布

            6、组间差异6mAPeak分析

            寻找6mADMR及注释

            7、差异6mAPeak基因分析

            相关基因GO,KEGG富集分析

            高级分析

            8、多组学整合关联分析

            例如与转录组关联分析

            9、其它定制化分析

            结合课题背景亮点挖掘

             

             

             

            未找到相应参数组,请于后台属性模板中添加

             

            案例分析:衣藻基因组6mA甲基化谱研究

            N6-Methyldeoxyadenosine Marks Active Transcription Start Sites in Chlamydomonas.Cell. 2015;7;161(4):879-892.

            一、研究背景

            N6-甲基脱氧腺苷(6mA)是原核生物和真核生物的DNA修饰类型。6mA在细菌中广泛存在,在DNA错配修复、染色体分离和毒力调节中发挥作用。相比之下,6mA在真核生物中的分布和功能还不清楚。

            二、方法流程

            取材:单衣藻(Chlamydomonas)

            测序:6mA免疫沉淀测序(6mA-IP Seq)

            验证:UHPLC-MS/MS: 整体6mA水平

            三、研究结果

            1、对衣原体基因组中的6mA进行了全面的分析,在84%的基因中鉴定出6mA修饰;

            2、6mA主要位于转录起始位点(TSS)附近的AT二核苷酸上,具有双峰分布,并显示出激活基因的标记;

            3、在6mA分布存在周期性模式, 与TSS附近的核小体分布有关,表明在核小体位置上可能起到作用。

            四、研究结论

            6mA的全基因组图谱及其在衣藻基因组中的独特分布表明6mA在真核生物基因表达中的潜在调控作用

             

            这是描述信息

            邮箱:marketing@sz-acegen.com

            官网:http://www.keramiacsempek.com

            地址:深圳市龙岗区立信路43号永昌大厦407-408室

            Copyright ? 2021  |  深圳市艾斯基因科技有限公司 All Rights Reserved.  |   粤ICP备16072881号  |  网站建设:中企动力 龙岗

            天天鲁夜夜啪视频在线|人人天天夜夜日日狠狠|日日摸天天摸人人看|久草网 营口市| 米泉市| 灵山县| 收藏| 民乐县| 大新县| 德州市| 略阳县| 砀山县| 商洛市| 曲沃县| 济源市| 边坝县| 合山市| 新密市| 安乡县| 浠水县| 抚远县| 新闻| 昌图县| 亳州市| 芒康县| 姜堰市| 永宁县| 汪清县| 米林县| 陇西县| 九龙坡区| 巴青县| 榆树市| 宜宾市| 宁都县| 固镇县| 南和县| 垫江县| 高雄县| 古交市| 宜昌市| 彝良县| 桂平市| 白银市| http://444 http://444 http://444 http://444 http://444 http://444